Первые упоминания о деревне Молзино, датируются 1846 годом. Согласно ведомости храма Рождества Христова, общее число дворов, приписанных к Ямкинской церкви - 144, число душ мужского пола - 693 , женского пола - 775. В это число входили дворы и жители деревни Молзино. Деревня Молзино принадлежала князьям Долгоруким, однако помещики в деревне не проживали.

     Среди наиболее выдающихся Молзинских купцов были купцы Антип Куприянович и Иван Антипович Куприяновы, купцы Фёдор Васильевич и Борис Фёдорович Зыковы, купец Гаврила Никифорович Титов. Борис Фёдорович Зыков так же с 1856-1914 являлся церковным старостой.

     Потомки купцов Куприяновых создали замечательный сайт на котором размещено много информации о деревне Молзино.

    В 1830 году Купцы Куприяновы организовали в деревне Молзино ткацкое предприятие. Предприятие было крупное, поэтому помимо местных жителей на нем работали жители из других регионов России. Численность рабочих достигала 300 человек.

     В 1849 году Гаврила Никифорович Титов основал в Молзино шёлковую фабрику, на которой работало 15 человек. Размещалась фабрика в деревянном корпусе и производила атлас. Купец Фёдор Васильевич Зыков происходил из крестьян деревни Молзино. На него работали крестьяне не только деревни Молзино, но и многих других окрестных деревень. В Москве у купцов Зыковых был магазин, где продавали шелка, бархат, парчу и атлас производимые работниками. 

     В 1865 купец Антип Куприянович Куприянов на свои средства построил в деревне Молзино школу. Школа была покрыта железом, и в ней были установлены печи, так же купец обеспечил школу всем необходимым: столы, книги и прочий учебный инвентарь. Школа была открыта для бесплатного обучения сельских детей и продолжала работать до 1894 года. В 1894 году было построено новое каменное здание в котором было размещено земское училище.

     В 1873 году в деревне Молзино открывается ноавое текстильное предприятие, что значительно увеличивает численность населения. Для работы на предприятии в деревню Молзино переселилось много людей из других районов России.

     С 1917 по 1994 годы, фактически во время советской власти, деревня несколько раз меняла принадлежность к разным муниципальным округам. В истории сохранились следующие даты и данные:

  • 1929—1930 Молзинский сельсовет Богородского района.
  • 1930—1954 Молзинский сельсовет Ногинского района.
  • 1954—1963, 1965—1994 Ямкинский сельсовет Ногинского района.
  • 1963—1965 Ямкинский сельсовет Орехово-Зуевского укрупнённого сельского района.
  • 1994—2006 Ямкинский сельский округ Ногинского района.

     С 2006 года по настоящее время деревня Молзино входит в городское поселение Ногинск, Ногинского муниципального района.